Banca de DEFESA: DANDARA DE PAULA CANDIDO

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : DANDARA DE PAULA CANDIDO
DATA : 21/06/2023
HORA: 14:00
LOCAL: https://conferenciaweb.rnp.br/webconf/carlos-mauricio-rabello-de-santanna
TÍTULO:

ESTUDO PELO MÉTODO SEMI-EMPÍRICO PM7 DE COMPLEXOS ENTRE O RBD DA PROTEÍNA SPIKE DO SARS-CoV-2 COM PEPTÍDEOS DERIVADOS DA hACE2, CANDIDATOS A INIBIDORES DA INFECÇÃO VIRAL

PALAVRAS-CHAVES:

COVID-19. Proteína Spike. Peptídeos derivados da hACE2. PM7. Inibição covalente

PÁGINAS: 93
RESUMO:

No final de 2019, o mundo conheceu uma nova doença viral, atualmente chamada de COVID-19, causada pelo coronavírus SARS-CoV-2. A COVID-19 se espalhou rapidamente pelo mundo, tendo causado mais de 6,94 milhões de mortes até hoje. Dentre as proteínas do SARS-CoV-2, a Spike tem despertado o interesse especial, visto que o coronavírus a utiliza para se ligar através do domínio de ligação ao receptor (RBD) à enzima conversora de angiotensina 2 humana (hACE2), iniciando, assim, a invasão na célula hospedeira. Um estudo in vitro recente demonstrou que peptídeos derivados da hACE2 contendo a sequência de aminoácidos EDLFYQ (SAP1, SAP2 e SAP6) são capazes de inibir a infecção viral mediada pela Spike. O objetivo deste projeto é empregar métodos teóricos para se investigar o modo de interação desses peptídeos com o RBD da Spike, de forma a se obter informações para o planejamento racional de novos peptídeos, candidatos a inibidores de infecção pelo SARS-CoV-2, explorando a estratégia de inibição covalente. Por envolver a formação de ligações covalentes, o estudo foi conduzido com o uso do método quântico semi-empírico PM7, que é rápido o suficiente para ser aplicado a proteínas inteiras e seus complexos. Todos os cálculos envolveram o RBD completo, usando a aproximação do contínuo para incluir o efeito do meio externo na minimização de energia, sem restrições estruturais. A proposta dos novos peptídeos foi baseada na química da troca enxofre-triazol (SuTEx), que permite seletividade para formação de ligações covalentes com resíduos de tirosina. Os SAPs foram modificados pela incorporação de grupos ogiva sulfonil-triazol, além de um novo grupo ogiva proposto fosfonil-triazol, de modo a elevar a eficiência da interação por meio de ligações covalentes. Dados de ΔHint calculados se correlacionaram com a Kd determinada experimentalmente para SAP1, SAP2 e SAP6, e confirmam o peptídeo SAP1 tanto nativo quanto com modificações do tipo SuTEx como melhores candidatos a ligantes do RBD, seguido pelos SAPs 6 e 2, nesta ordem. Também foi observado que os complexos covalentes formados pelo SAP1com grupos ogiva sulfonil-triazol demonstraram ser mais estáveis entalpicamente, indicando uma maior tendência de serem formados e persistirem no meio em que foram estudados do que aqueles contendo grupos ogiva fosfonil-triazol.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1220404 - CARLOS MAURICIO RABELLO DE SANT ANNA
Interna - 387189 - AUREA ECHEVARRIA AZNAR NEVES LIMA
Externa à Instituição - NELILMA CORREIA ROMEIRO - UFRJ