Banca de QUALIFICAÇÃO: LUCAS AGUIAR ROSA MACHADO

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
ÉTUDIANTS: LUCAS AGUIAR ROSA MACHADO
DATE: 01/12/2025
TIME: 09:00
LOCAL: Departamento de Parasitologia Animal
TITRE:

Validation et mise en œuvre à l'échelle nationale d'une plateforme en ligne pour l'identification moléculaire des tiques brésiliennes.

MOTS-CLÉS:

Mots-clés : PCR-RFLP, Ixodida, Rickettsia.

PAGES: 67
GRANDE SURFACE: Ciências Agrárias
AREA: Medicina Veterinária
SOUS-ZONE: Medicina Veterinária Preventiva
SPÉCIALITÉ: Doenças Parasitárias de Animais
RÉSUMÉ:

Les tiques et les rickettsies sont des organismes d'intérêt pour la santé humaine et animale en raison des maladies qu'elles transmettent ou provoquent. Le Brésil possède une riche diversité d'espèces de ces organismes, et de nouvelles espèces continuent d'être découvertes. Malgré cela, en raison du coût élevé du séquençage, les études récentes ne parviennent pas à identifier toutes les tiques au niveau de l'espèce, se limitant aux larves au niveau du genre. Par ailleurs, la co-infection par les rickettsies est un phénomène mal compris et difficile à observer avec des amorces universelles. Des méthodes d'identification des tiques et des rickettsies basées sur la PCR-RFLP, moins coûteuses, ont été précédemment développées par LBioMol. La présente étude visait à faciliter l'utilisation de ces méthodes, à générer de nouveaux profils d'identification pour les tiques et à confirmer la qualité des séquences utilisées pour créer et mettre à jour la méthode d'identification des tiques. À cette fin, une analyse des séquences d'ADNr 16S d'Ixodida brésiliennes a été réalisée et, dans le cas des séquences d'Amblyomma spp., les données d'origine et de taille ont été enregistrées et comparées. Toutes les séquences collectées ont été alignées à 100 % de similarité pour la création d'haplotypes, et des tableaux de variation ont été créés pour la comparaison des espèces d'*Amblyomma*. Les haplotypes ont été alignés à 97 % de similarité et utilisés pour établir un consensus, lequel a ensuite servi à l'analyse phylogénétique. Les profils de digestion des haplotypes d'*Ixodida* ont été générés par digestion in silico. Pour les rickettsies, les profils générés par LBioMol ont été intégrés à un outil en ligne développé avec Wix. Au total, 48,31 % des séquences collectées provenaient du Brésil, tandis que les séquences restantes provenaient de 17 pays différents ou n'avaient pas d'origine précisée. Vingt-neuf séquences, initialement attribuées à une espèce erronée, ont été observées et les espèces correctes ont été identifiées par BLAST. Deux arbres phylogénétiques ont été construits, générant un total de 176 profils de digestion pour 74 espèces de tiques présentes au Brésil. Une clé dichotomique a été créée pour faciliter l'identification de ces espèces. L'outil en ligne a été développé pour les espèces de *Rickettsia*. Permet l'identification des espèces et des souches présentes au Brésil grâce à différentes cibles moléculaires.

MEMBRES DE LA BANQUE:
Interno - 1354903 - DOUGLAS MCINTOSH
Interno - 3701492 - HUARRISSON AZEVEDO SANTOS
Interna - 3103478 - MARISTELA PECKLE PEIXOTO
Externa ao Programa - 1815763 - IRENE DA SILVA COELHO - UFRRJ