Validación e implementación a nivel nacional de una plataforma en línea para la identificación molecular de garrapatas brasileñas.
Palabras clave: PCR-RFLP, Ixodida, Rickettsia.
Las garrapatas y las rickettsias son organismos de interés para la salud humana y animal debido a las enfermedades que transmiten o causan. Brasil posee una rica diversidad de especies de estos organismos, y aún hoy se siguen descubriendo nuevas especies. Sin embargo, debido al alto costo de la secuenciación, los estudios recientes no logran identificar todas las garrapatas a nivel de especie, dejando las larvas al nivel de género. Por otro lado, la coinfección por rickettsias es un fenómeno poco conocido y difícil de observar con cebadores universales. LBioMol desarrolló previamente métodos de menor costo basados en PCR-RFLP para la identificación de garrapatas y rickettsias. El presente estudio tuvo como objetivo facilitar el uso de estos métodos, generar nuevos perfiles de identificación para garrapatas y confirmar la calidad de las secuencias utilizadas para crear y actualizar el método para garrapatas. Para ello, se realizó un análisis de secuencias de ADNr 16S de Ixodida brasileñas y, en el caso de las secuencias de Amblyomma spp., se registraron y compararon los datos de origen y tamaño. Todas las secuencias recolectadas se alinearon con una similitud del 100% para la creación de haplotipos, y se crearon tablas de variación para la comparación de especies de *Amblyomma*. Los haplotipos se alinearon con una similitud del 97% y se utilizaron para crear un consenso, que a su vez se empleó en la filogenia. Se generaron perfiles de digestión para los haplotipos de *Ixodida* mediante digestión in silico. Para las rickettsias, los perfiles generados por LBioMol se introdujeron en una herramienta en línea creada con Wix. En total, el 48,31% de las secuencias recolectadas procedían de Brasil, mientras que las restantes se recolectaron en 17 países diferentes o no tenían su origen reportado. Se observaron veintinueve secuencias depositadas con la especie incorrecta, y las especies correctas se identificaron mediante BLAST. Se construyeron dos árboles filogenéticos, generando un total de 176 perfiles de digestión para 74 especies de garrapatas encontradas en Brasil. Se creó una clave dicotómica para facilitar la identificación de estas especies. La herramienta en línea creada para Rickettsia spp. Permite la identificación de especies y cepas presentes en Brasil mediante diferentes marcadores moleculares.