Estudo das Características Morfométricas e da Associação Genômica Ampla (GWAS) em Equinos da Raça Campolina
Cavalo, conformação, genética equina, melhoramento genético equino, morfometria.
Krebs, Lisia Castro. Estudo das Características Morfométricas e da Associação Genômica Ampla (GWAS) em Equinos da Raça Campolina. 2021. N. 146. Dissertação de mestrado. Pós-Graduação em Zootecnia, Programa de Pós-Graduação em Zootecnia, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, RJ, 2021. Os estudos em análises morfométricas dos equinos progrediram nos últimos anos; sempre partindo da premissa desta avaliação estar relacionada com a aptidão do cavalo. Com o avanço da avaliação genética na equinocultura criou-se a oportunidade de obter informações precisas sobre a funcionalidade dos animais, assim como a maior exatidão da descendência e obter o gene desejado. Esta pesquisa objetiva-se realizar estudo das características fenotípicas e o Estudo de Associação Genômica Ampla (GWAS) de medidas morfométricas em equinos da raça Campolina. Foram mensurados 267 equinos, com idade acima de 36 meses de idade, registrados na Associação Brasileira dos Criadores do Cavalo Campolina (ABCCCampolina), pertencentes aos estados da Bahia, Rio de Janeiro e Minas Gerais, para a análise fenotípica de 45 medidas morfométricas. Destes equinos foram selecionados, com base no pedigree, 48 animais para extração do DNA para posterior realização do GWAS. E, para identificar os genes relacionados as medidas morfométricas, foram utilizados 18.876 registros genealógicos de equinos disponibilizados pela ABCCCampolina, no qual continha as informações de 15 medidas morfométricas. O DNA genômico foi extraído de amostras de bulbo capilar utilizando o kit Nucleospin Tissue. Posteriormente a extração do DNA, ocorreu a genotipagem do DNA com a utilização do chip GGP Equine Illumina-24 Kit~65000SNP. As análises estatísticas de correlação de Pearson, covariância, análise discriminante e componentes principais, e foram realizadas para os dados fenotípicos. Após foi realizado o GWAS. Todas as análises foram realizadas utilizando o Rstudio®. Na análise de correlação de Pearson observou-se que as medidas lineares e de perímetro correlacionam positivamente com as 44 medidas morfométricas. A maioria das medidas angulares possuem correlações não significantes com as medidas morfométricas. Verificou-se que na análise de covariância, de componentes principais (CP), e discriminante que os machos apresentaram menor variação das medidas lineares e de perímetros em relação as fêmeas. Na análise de GWAS observou-se que as 15 medidas morfométricas avaliadas apresentaram genes candidatos, que foram responsáveis por explicar mais de 1% da variação genética ocorrida em equinos da raça Campolina. Conclui-se que na raça Campolina, as medidas lineares e de perímetros são as medidas morfométricas mais indicadas para classificação dos equinos quanto ao sexo, apresentando maior dimorfismo sexual quando comparadas as medidas angulares. Os possíveis genes candidatos para as medidas morfométricas avaliadas foram: RBMS3, HAUS, PIK3R1, SUCLG2, ZCWPW2, CLYBL, DNAJC3, DNAJC15, KMO, LMOD3, LOC100630169, LOC102148584, LRCH1 e THRB.